هذا هو الأمر bp_run_protdist.plp الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
run_neighbor - قم بتشغيل برنامج Phylip's "protdist" من خلال Bioperl
موجز
run_protdist [-i ملف الإدخال] [-o اسم الملف الخارجي]
الوصف
قم بتوفير ملف محاذاة لتشغيل protdist عليه. يجب تسمية الملف إما .aln أو .phy.
هذا مطلوب حتى نتمكن من تحديد ما إذا كنا بحاجة إلى تحويل محاذاة clustalw إلى
phylip. نرحب بك لتوسيع البرنامج النصي للعمل على تنسيقات MSA الأخرى التي تستخدم bioperl
يدعم. هذا مخصص للاستخدام في خطوط الأنابيب اليدوية البسيطة جدًا.
يجب تسمية ملف الإدخال بصيغة file.phy أو file.aln يتوقع البرنامج وجود ملف
ملف على شكل (\ S +) \. (\ S +).
سيؤدي هذا إلى تشغيل التطبيق "protdist" باستخدام صيغة "KIMURA" لبناء بروتين aa
مصفوفة المسافة. أولئك الذين لديهم phylip3.6 سيرغبون في إجراء بعض التغييرات إذا كانوا يريدون استخدامها
JTT. يسعدني المساعدة في إضافة هذا كوسيطة سطر cmd إذا طُلب ذلك.
استخدم bp_run_protdist.plp عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net