هذا هو الأمر gmod_bulk_load_pubmed.plp الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
gmod_bulk_load_pubmed.pl - يخزن الإدخالات المنشورة في قاعدة البيانات
الوصف
الاستخدام: بيرل gmod_bulk_load_pubmed.pl -H [dbhost] -D [dbname] [-vt] -i ملف
المعلمات
-H اسم المضيف لقاعدة البيانات
-د اسم قاعدة البيانات
-i ملف الإدخال [مطلوب]
-v مطول الإخراج
-t الوضع التجريبي. لا تقم بأي عمليات مخزن على الإطلاق.
-g اسم ملف تعريف قاعدة بيانات GMOD (يمكن توفير اسم المضيف وقاعدة البيانات) الافتراضي: "افتراضي"
If ليست استخدام a GMOD قاعدة بيانات البيانات الشخصية (اختيار -ز) then لصحتك! يجب تزود القادم متابعيك
المعلمات
-اسم المستخدم
-d اسم برنامج تشغيل قاعدة البيانات (على سبيل المثال "Pg" لـ postgres)
-p كلمة المرور للمستخدم للاتصال بقاعدة البيانات
يقوم البرنامج النصي بتخزين الإدخالات المنشورة في قاعدة البيانات. يتم تجاهل تلك الموجودة. ملف الإدخال
يجب أن تحتوي على قائمة معرفات Pubmed. ثم كائن منشور جديد
(السيرة الذاتية::Chado::Schema::Pub::Pub) مع الانضمام= PMID، يتم جلب مواصفات النشر
من Entrez (باستخدام eUtils) الذي يقوم بتعيين الحقول المختلفة في كائن النشر. متى
يتم تخزين المنشور، ويتم تخزين dbxref جديد أولاً (راجع وحدة Chado العامة)
هذه سيناريو أعمال مع شادو مخطط و الوصول القادم متابعيك الجداول:
حانة
الناشر
com.pubprop
com.dbxref
pub_dbxref
استخدم gmod_bulk_load_pubmed.plp عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net