هذا هو تطبيق Linux المسمى Genome Microsatellite Analyzing Tool والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم gmatoV1.2Build20130106.zip. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق عبر الإنترنت المسمى Genome Microsatellite Analyzing Tool مع OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
لقطات الشاشة:
أداة تحليل الجينوم للأقمار الصناعية الدقيقة
الوصف:
أدى التوافر المتزايد للتسلسل للجينومات الكاملة الضخمة أكثر فأكثر (> 1G) إلى التغلب على أدوات تحليل SSR الحالية. تعد أداة تحليل الأقمار الصناعية الدقيقة على مستوى الجينوم (GMATo) برنامجًا قويًا جديدًا لتعدين SSR بشكل أسرع بأي طول وأي حجم، وتحليل إحصائي شامل في جانب الجينوم، مصمم خصيصًا للجينوم الضخم استنادًا إلى نصوص Perl. مطلوب ملف إدخال واحد فقط يحتوي على تسلسلات الحمض النووي بتنسيق فاستا الخام وملفات الإخراج بتنسيق جدولي تسرد جميع معلومات مواقع SSR والتوزيع الإحصائي في أربعة تصنيفات مهتمة بعلم الأحياء. يتمتع GMATo أيضًا بواجهة مستخدم سهلة ورسومية مكتوبة بلغة Java وواجهة سطر أوامر بلغة Perl، إما تعمل على أنظمة Windows وLinux وMac وما إلى ذلك مع إمكانية التحكم في المعلمات المخصصة بسهولة لعلماء الأحياء وأخصائيي المعلومات الحيوية. يعد برنامج GMATo أداة أفضل لتوصيف SSR في جينوم ضخماستشهد بهذه الورقة: Wang X. et al، Bioinformation [2013, 9(10):541-544]
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/gmato/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.