هذا هو تطبيق Linux المسمى PTESFinder والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم ptesfinder_v1.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل هذا التطبيق المسمى PTESFinder وتشغيله عبر الإنترنت مجانًا مع OnWorks.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
PTESfinder
الوصف:
PTESFinder عبارة عن خط أنابيب حسابي لتحديد أحداث Exon Shuffleing بعد النسخ من بيانات RNAseq عالية الإنتاجية. يستفيد PTESFinder من قوة أدوات RNASeq القائمة ويستبعد بشكل منهجي جميع الفئات المعروفة من الهياكل الإيجابية الكاذبة من خلال تطبيق مرشحات صارمة مصممة لاستهداف هذه الإيجابيات الكاذبة على وجه التحديد. يقارن PTESFinder صفات المحاذاة الخاصة برسم خرائط القراءات بهياكل PTES المفترضة مع صفات نفس القراءات عند تعيينها إلى المناطق الجينومية والنصوص المقسمة بشكل قانوني. يزيد هذا النهج من الثقة في دعم PTES للقراءات. غالبًا ما تتميز القراءات الصادرة عن أحداث تبديل القالب بوحدات إندل كبيرة عند محاذاتها مع النص. يستخدم PTESFinder مرشحات إضافية لاستبعاد القراءات ذات المحاذاة الغامضة حول تقاطعات PTES exon-exon، مما يزيد من الثقة في هذه القراءات الداعمة. يحدد PTESFinder المزيد من هياكل PTES مقارنة بالطرق المنشورة الأخرى مع الحفاظ على خصوصية عالية.
الجمهور
بحث علمي
واجهة المستخدم
سطر الأوامر
لغة البرمجة
شل يونكس ، جافا
الفئات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/ptesfinder-v1/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.