এলিয়েন_হান্টার - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

এলিয়েন_হান্টার - অনুভূমিকভাবে সনাক্তকরণের জন্য ইন্টারপোলেটেড ভেরিয়েবল অর্ডার মোটিফ
ডিএনএ অর্জন করেছে

সাইনোপিসিস

এলিয়েন_হান্টার [অপশন সমূহ]

বর্ণনাঃ

এলিয়েন_হান্টার হল অনুভূমিক জিন স্থানান্তরের পূর্বাভাসের জন্য একটি অ্যাপ্লিকেশন
ইন্টারপোলেটেড ভেরিয়েবল অর্ডার মোটিফস (IVOMs) বাস্তবায়নের সাথে (HGT) ঘটনা। একটি
IVOM পদ্ধতি পরিবর্তনশীল ক্রম মোটিফ বিতরণ এবং ব্যবহার করে রচনাগত পক্ষপাতকে কাজে লাগায়
স্থির-ক্রমের তুলনায় একটি অনুক্রমের স্থানীয় রচনা আরও নির্ভরযোগ্যভাবে ক্যাপচার করে
পদ্ধতি ঐচ্ছিকভাবে ভবিষ্যদ্বাণীগুলিকে 2-স্টেট 2য় অর্ডার হিডেন মার্কভ-এ পার্স করা যেতে পারে
মডেল (HMM), একটি পরিবর্তন-বিন্দু সনাক্তকরণ কাঠামোর মধ্যে, এর স্থানীয়করণকে অপ্টিমাইজ করতে
পূর্বাভাসিত অঞ্চলের সীমানা। ভবিষ্যদ্বাণী (প্রতীকের বিন্যাস) স্বয়ংক্রিয়ভাবে হতে পারে
আর্টেমিস জিনোম ভিউয়ারে লোড করা এখানে অবাধে উপলব্ধ:
http://www.sanger.ac.uk/Software/Artemis/.

ইনপুট: কাঁচা জিনোমিক সিকোয়েন্স পূর্বাভাস: ইন্টারপোলেটেড ভেরিয়েবল অর্ডারের উপর ভিত্তি করে এইচজিটি অঞ্চল
মোটিফ (IVOMs) আর্গুমেন্ট:


কাঁচা জিনোমিক ক্রম


আউটপুট ডেটার জন্য ফাইলের নাম

ঐচ্ছিক যুক্তি:

-এ আর্টেমিসে ভবিষ্যদ্বাণী ফাইল লোড করতে

-c পরিবর্তন-বিন্দু সনাক্তকরণ 2 রাজ্য 2য় ক্রম HMM সহ পূর্বাভাসিত সীমানা অপ্টিমাইজ করুন

আউটপুট ফাইল:


এমবিএল ফরম্যাটে ভবিষ্যদ্বাণী (ট্যাব ফাইল)

.opt
অপ্টিমাইজ করা (HMM) পূর্বাভাস (ট্যাব ফাইল) embl বিন্যাসে

.পটভূমি
আর্টেমিস ইউজার প্লট ফরম্যাটে ভবিষ্যদ্বাণী গ্রাফ -> অ্যাড ব্যবহার করে ম্যানুয়ালি লোড করা হবে
ব্যবহারকারী প্লট...

.opt.plot
আর্টেমিস ইউজার প্লট ফরম্যাটে অপ্টিমাইজ করা (HMM) ভবিষ্যদ্বাণী ম্যানুয়ালি ব্যবহার করে লোড করা হবে
গ্রাফ -> ব্যবহারকারী প্লট যোগ করুন...

.sco
সমস্ত স্লাইডিং উইন্ডোতে স্কোর - স্কোর বিতরণ চেকের জন্য

দ্রষ্টব্য: rRNA অপেরনের সাথে ওভারল্যাপ হওয়া ভবিষ্যদ্বাণীগুলি নোট কোয়ালিফায়ারে উল্লেখ করা হয়েছে

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে alien_hunter অনলাইন ব্যবহার করুন