gmx-saltbr - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

gmx-saltbr - লবণ সেতু গণনা করুন

সাইনোপিসিস

gmx saltbr [-f [<.xtc/.trr/...>]] [-s [<.tpr>]] [-b ] [-e ]
[-তারিখ ] [-t ] [-[না]সেপ্টেম্বর]

বর্ণনাঃ

জিএমএক্স লবণ একটি ফাংশন হিসাবে চার্জযুক্ত গোষ্ঠীর সমস্ত সমন্বয়ের মধ্যে দূরত্ব প্লট করে
সময় দলগুলি বিভিন্ন উপায়ে একত্রিত হয়। একটি সর্বনিম্ন দূরত্ব দেওয়া যেতে পারে (যেমন ক
কাট-অফ), এমন যে গোষ্ঠীগুলি কখনও সেই দূরত্বের চেয়ে কাছাকাছি নয় এমন প্লট করা হবে না।

আউটপুট বেশ কয়েকটি নির্দিষ্ট ফাইলের নামে থাকবে, min-min.xvg, plus-min.xvg এবং
plus-plus.xvg, অথবা প্রতিটি পৃথক আয়ন জোড়ার জন্য ফাইল যদি -সেপ্টেম্বর বিকল্প নির্বাচন করা হয়। ভিতরে
এই ক্ষেত্রে, ফাইল হিসাবে নামকরণ করা হয় sb-(পুনরায় নাম)(Resnr)-(Atomnr)। থাকতে পারে অনেক এই ধরনের ফাইল।

বিকল্প

ইনপুট ফাইল নির্দিষ্ট করার বিকল্প:

-f [<.xtc/.trr/...>] (traj.xtc)
গতিপথ: পরমানন্দ trr CPT GRO g96 পিডিবি tng

-s [<.tpr>] (topol.tpr)
পোর্টেবল xdr রান ইনপুট ফাইল

অন্যান্য বিকল্পগুলি:

-b (0)
ট্রাজেক্টোরি থেকে পড়ার জন্য প্রথম ফ্রেম (ps)

-e (0)
ট্রাজেক্টোরি থেকে পড়ার জন্য শেষ ফ্রেম (ps)

-তারিখ (0)
শুধুমাত্র ফ্রেম ব্যবহার করুন যখন t MOD dt = প্রথমবার (ps)

-t (1000)
যে গোষ্ঠীগুলি এই দূরত্বের থেকে কখনও কাছাকাছি হয় না তাদের প্লট করা হয় না

-[না]সেপ্টেম্বর (NO)
প্রতিটি ইন্টারঅ্যাকশনের জন্য আলাদা ফাইল ব্যবহার করুন (অনেক হতে পারে)

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে gmx-saltbr ব্যবহার করুন