এটি হল GWAMA কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
GWAMA - জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন মেটা বিশ্লেষণ
সাইনোপিসিস
GWAMA [অপশন]
বর্ণনাঃ
GWAMA (জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন মেটা অ্যানালাইসিস) সফ্টওয়্যার মেটা-বিশ্লেষণ করে
বাইনারি বা পরিমাণগত ফিনোটাইপগুলির GWA গবেষণার ফলাফল। স্থির- এবং র্যান্ডম-প্রভাব
মেটা-বিশ্লেষণ অনুমান ব্যবহার করে সরাসরি জিনোটাইপ করা এবং অভিযুক্ত SNPs উভয়ের জন্য সঞ্চালিত হয়
বাইনারি বৈশিষ্ট্যের জন্য অ্যালিলিক অডস অনুপাত এবং 95% আত্মবিশ্বাসের ব্যবধান এবং এর অনুমান
পরিমাণগত ফেনোটাইপগুলির জন্য অ্যালিলিক প্রভাবের আকার এবং মানক ত্রুটি। GWAMA ব্যবহার করা যেতে পারে
সমস্ত বিভিন্ন জেনেটিক মডেলের ফলাফল বিশ্লেষণের জন্য (গুণ, সংযোজন,
প্রভাবশালী, পশ্চাদপসরণকারী)। সফ্টওয়্যার সনাক্ত করার জন্য ত্রুটি ফাঁদ সুবিধা অন্তর্ভুক্ত
স্ট্র্যান্ড অ্যালাইনমেন্ট ত্রুটি এবং অ্যালিল ফ্লিপিং, এবং এর ভিন্নতা পরীক্ষা করে
গবেষণার মধ্যে প্রভাব।
বিকল্প
-i, -- ফাইললিস্ট=ফাইলের নাম
অধ্যয়নের ফলাফল ফাইলগুলি নির্দিষ্ট করুন। ডিফল্ট = gwama.in
-o, --আউটপুট=ফাইলরুট
বিশ্লেষণের আউটপুট জন্য ফাইল রুট নির্দিষ্ট করুন. ডিফল্ট = gwama (gwama.out, gwama.gc.out)
-r, --এলোমেলো
এলোমেলো প্রভাব সংশোধন ব্যবহার করুন. ডিফল্ট = নিষ্ক্রিয়
-জিসি, --জিনোমিক_নিয়ন্ত্রণ
গবেষণার ফলাফল ফাইল সামঞ্জস্য করার জন্য জিনোমিক নিয়ন্ত্রণ ব্যবহার করুন। ডিফল্ট = নিষ্ক্রিয়
-জিসিও, --জিনোমিক_কন্ট্রোল_আউটপুট
মেটা-বিশ্লেষণ সারাংশে জিনোমিক নিয়ন্ত্রণ ব্যবহার করুন (অর্থাৎ মেটা-বিশ্লেষণের ফলাফলগুলি হল
জিসির জন্য সংশোধন করা হয়েছে)। ডিফল্ট = নিষ্ক্রিয়
-qt, -- পরিমাণগত
পরিমাণগত বৈশিষ্ট্য সংস্করণ নির্বাচন করুন (BETA এবং SE কলাম)। ডিফল্ট = বাইনারি বৈশিষ্ট্য
-m, --মানচিত্র=ফাইলের নাম
মার্কার মানচিত্রের জন্য ফাইলের নাম নির্বাচন করুন।
-t, -- প্রান্তিক=0-1
সারাংশ প্রভাবের দিকনির্দেশে দিক দেখানোর জন্য p-মান থ্রেশহোল্ড। ডিফল্ট =
1
--নো_অ্যালেলেস
কোন অ্যালিল তথ্য দেওয়া হয়নি. সবসময় একই EA আশা করা হচ্ছে।
--ইন্ডেল_অ্যালেলেস
অ্যালিল লেবে একক অক্ষরের বেশি থাকতে পারে। কোন স্ট্র্যান্ড চেক.
--সেক্স লিঙ্গ-বিভেদ এবং লিঙ্গ-বিচিত্রতা বিশ্লেষণ চালান (এতে বর্ণিত পদ্ধতি
কাগজ ম্যাগি, লিন্ডগ্রেন এবং মরিস 2010)। লিঙ্গ সংক্রান্ত তথ্য অবশ্যই ফাইললিস্ট ফাইলে প্রদান করতে হবে।
(ফাইলের নামের পরে দ্বিতীয় কলামটি হয় M বা F)।
--নাম_মার্কার
মার্কার নামের কলের বিকল্প হেডার।
--নাম_স্ট্র্যান্ড
স্ট্র্যান্ড কলামে বিকল্প হেডার।
--নাম_এন
নমুনা আকার কলের বিকল্প হেডার।
--নাম_ইএ
অ্যালিল কলামে প্রভাব ফেলতে বিকল্প হেডার।
--নাম_নিয়া
অ-প্রভাবিত অ্যালিল কলামের বিকল্প হেডার।
--নাম_ইফ
অ্যালিল ফ্রিকোয়েন্সি কলামকে প্রভাবিত করতে বিকল্প হেডার।
--নাম_বেটা
বিটা কলামে বিকল্প হেডার।
--নাম_সে
বিকল্প শিরোনাম থেকে std. ভুল কর্নেল
--নাম_বা
OR কলামের বিকল্প হেডার।
--নাম_বা_95l
OR 95L কলামের বিকল্প হেডার।
--name_or_95u
OR 95U কলামের বিকল্প হেডার।
-h, --help
এই সাহায্য প্রিন্ট করুন.
-v, --সংস্করণ
GWAMA সংস্করণ নম্বর প্রিন্ট করুন। এই ম্যানুয়াল পৃষ্ঠাটি অবশ্যই অপর্যাপ্ত হতে হবে। ব্যবহার করুন
gwama এর বিকল্পগুলির একটি দ্রুত অনুস্মারক বা এর হোম পেজে চালু করার জন্য সাহায্য বিকল্প
অনলাইন ডকুমেন্টেশন বা ডাউনলোডযোগ্য ম্যানুয়াল সহ।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে GWAMA অনলাইন ব্যবহার করুন