এটি হল mipe2dbSTS কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
mipe2dbSTS.pl - dbSTS-এ জমা দেওয়ার জন্য ইনপুট ফাইল তৈরি করে
আউটপুটে অন্তর্ভুক্ত: dbSTS জমা দেওয়ার STS বিভাগ
MIPE সংস্করণ v1.1 এর উপর ভিত্তি করে
আর্গুমেন্ট: * mipe_file
* কনফিগার ফাইল
* (ঐচ্ছিক) পিসিআর আইডিগুলির তালিকা
কনফিগার ফাইলে একটি কী এবং একটি মান সমন্বিত লাইন থাকে, একটি সমান চিহ্ন ('=') দ্বারা পৃথক করা হয়।
কীটিতে NCBI জমা দেওয়া ফাইলের ছোট হাতের নাম থাকে (dbSTS ওয়েবসাইট দেখুন), তারপরে
একটি আন্ডারস্কোর এবং সেই ফাইলের ক্ষেত্রের ছোট হাতের নাম।
নিম্নলিখিত ক্ষেত্রগুলি কনফিগার ফাইলে সংজ্ঞায়িত করা উচিত:
pub_title=
pub_authors=
উৎস_নাম=
source_organism=
cont_name=
cont_fax=
cont_tel=
cont_email=
cont_lab=
cont_inst=
cont_addr=
protocol_name=
protocol_protocol=
বাফার_নাম=
buffer_buffer=
sts_pcr_profile=
protocol_protocol, buffer_buffer এবং sts_pcr_profile এর জন্য, আরো লাইন প্রয়োজন (উদাহরণ দেখুন)।
একটি কনফিগার ফাইলের একটি উদাহরণ এই মত দেখায়:
pub_title=মুরগির SNP-এর জেনেটিক ম্যাপিং
pub_authors=Aerts,JA; বীনেন্দাল, টি.; Crooijmans,RPMA; গ্রেনেন, ম্যাম
উৎস_নাম = মুরগির জিনোমিক ডিএনএ
source_organism=গ্যালাস গ্যালাস
cont_name=Jan Aerts
cont_fax=+31 317 483929
cont_tel=+31 317 483397
cont_email=jan.aerts@wur.nl
cont_lab=প্রাণী প্রজনন এবং জিনোমিক্স গ্রুপ
cont_inst=ওয়াগেনিংজেন বিশ্ববিদ্যালয়
cont_addr=PO বক্স 338, 6700 AH Wageningen, নেদারল্যান্ডস
protocol_name=Protocol_Aerts
protocol_protocol=টেমপ্লেট: 30-60 ng
protocol_protocol=প্রাইমার: প্রতিটি 4 uM
protocol_protocol=dNTPs: প্রতিটি 200 uM
protocol_protocol=Taq: 0.3 ইউনিট
protocol_protocol = ভলিউম: 12 ul
buffer_name=Buffer_Aerts
buffer_buffer=MgCl2: 1.5 মিমি
বাফার_বাফার=(NH4)2SO4: 20 মিমি
buffer_buffer=Tris-HCl: 75 মিমি
বাফার_বাফার=টুইন 20: 0.01% (w/v)
buffer_buffer=pH: 8.8
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে mipe2dbSTS ব্যবহার করুন