এটি হল কমান্ড প্রোঅ্যালাইন যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
proalign - একটি সম্ভাব্য একাধিক প্রান্তিককরণ প্রোগ্রাম
সাইনোপিসিস
proalign [বিকল্প]
বর্ণনাঃ
কমান্ড লাইন থেকে শুধুমাত্র প্রোগ্রামের সীমিত ব্যবহার সম্ভব। এর সাথে সংস্করণ ব্যবহার করা ভাল
GUI (বিকল্প ছাড়াই শুরু করুন)।
বিকল্প
-নোগুই ফোর্স কমান্ড লাইন
-seqfile= ফাইল>
-ট্রিফাইল= ফাইল>
-নতুন গাছ
একটি নতুন গাইড গাছ গণনা
-নমুনা
নমুনা ট্রেসব্যাক পথ; যদি না দেওয়া হয়, ভিটারবি বেছে নেওয়া হয়
-ডেল্টা= ডেল্টা> or -ডেল্টা = অনুমান
দেওয়া না হলে, ডিফল্ট ব্যবহার করা হয়
-এপসিলন = epsilon> or -এপসিলন = অনুমান
দেওয়া না হলে, ডিফল্ট ব্যবহার করা হয়
- gapfreq= ফ্রিকোয়েন্সি>
দেওয়া না হলে, ডিফল্ট ব্যবহার করা হয়
-গ্যাপ্রব= প্রতিকল্পন সম্ভাবনা >
দেওয়া না হলে, ডিফল্ট ব্যবহার করা হয়
-প্রস্থ= দল প্রস্থ>
দেওয়া না হলে, ডিফল্ট ব্যবহার করা হয়
- ডিস্টস্কেল = স্কেল ফ্যাক্টর>
শাখার দৈর্ঘ্যের জন্য
-সংশোধন
গাইড ট্রি কম্পিউটেশনে যুগলভাবে দূরত্বের জন্য কোন সংশোধন নেই
-নোট্রেলিং
কোন ট্রেলিং সিকোয়েন্স কারেকশন নেই
-পরবর্তী = ক্রম সংশোধন দৈর্ঘ্য>
অনুপস্থিত শেষ জন্য
-দণ্ড=সত্য, or = মিথ্যা
গাইড গাছের জন্য জোড়ার মতো প্রান্তিককরণের শেষ ফাঁকগুলিকে শাস্তি দিন
-লেখক
সাইটগুলির গড় পশ্চাৎপদ সম্ভাব্যতা লিখুন
- সব লিখুন
প্রতিটি নোডের পরবর্তী সম্ভাব্যতা লিখুন
-writeroot
রুট নোড অক্ষর সম্ভাব্যতা লিখুন
-ওয়াগ WAG সম্ভাব্যতা টেবিল ব্যবহার করুন
-ডেহফ
ডেহফ সম্ভাব্যতা টেবিল ব্যবহার করুন
-জেটিটি JTT সম্ভাব্যতা টেবিল ব্যবহার করুন
-আউটফাইল= ফাইল>
-আউটফরম্যাট = পীর, -আউটফরম্যাট = এমএসএফ, -আউটফরম্যাট = ফিলিপ, or -আউটফরম্যাট = নেক্সাস
আউটপুট ফরমেট
- শান্ত কোন লগ
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে প্রোঅ্যালাইন ব্যবহার করুন