vcf-query - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

vcf-query - প্রশ্ন VCF ফাইল

সাইনোপিসিস

query-vcf [বিকল্প] file.vcf.gz

বিকল্প

-c, --কলাম
কমা দ্বারা পৃথক করা কলাম নামের তালিকা।

-f, --ফরম্যাট
ডিফল্ট হল '%CHROM:%POS\t%REF[\t%SAMPLE=%GT]\n'

-l, --তালিকা-কলাম
তালিকা কলাম।

-r, --অঞ্চল chr: থেকে থেকে
অঞ্চল পুনরুদ্ধার করুন. (টাবিক্স চালায়।)

-h, -?, --help
এই সাহায্য বার্তা.

উদাহরণ

query-vcf file.vcf.gz 1:1000-2000 -c NA001,NA002,NA003 প্রশ্ন-vcf ফাইল.vcf.gz -r
1: 1000-2000 -f '%CHROM:%POS\t%REF[\t%SAMPLE:%*=,]\n' query-vcf file.vcf.gz -f
'[%GT\t]%LINE\n' query-vcf file.vcf.gz -f '% CHROM\t%POS\t%INFO/DP\t%FILTER\n'

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে vcf-query ব্যবহার করুন