This is the Linux app named clusterProfiler whose latest release can be downloaded as clusterProfilersourcecode.tar.gz. It can be run online in the free hosting provider OnWorks for workstations.
clusterProfiler নামের এই অ্যাপটি OnWorks সহ বিনামূল্যে অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রিনশট:
ক্লাস্টারপ্রোফাইলার
বর্ণনাঃ
clusterProfiler হল একটি R/Bioconductor প্যাকেজ যা উচ্চ-থ্রুপুট ওমিক্স ফলাফল ব্যাখ্যা করার জন্য কার্যকরী সমৃদ্ধি বিশ্লেষণের জন্য একটি সমন্বিত কর্মপ্রবাহ প্রদান করে। এটি অতিরিক্ত প্রতিনিধিত্ব বিশ্লেষণ এবং জিন সেট সমৃদ্ধি বিশ্লেষণ উভয়কেই সমর্থন করে, যা আপনাকে অ-র্যাঙ্ক করা জিন তালিকা বা ডিফারেনশিয়াল পাইপলাইন থেকে র্যাঙ্ক করা পরিসংখ্যানের সাথে কাজ করতে দেয়। প্যাকেজটি একাধিক জ্ঞান ভিত্তির সাথে সংযোগ স্থাপন করে—যেমন জিন অন্টোলজি, KEGG, Reactome, রোগ অন্টোলজি, MeSH এবং অন্যান্য—একটি সামঞ্জস্যপূর্ণ ইন্টারফেসের মাধ্যমে যাতে আপনি কোড পুনর্লিখন ছাড়াই বিভিন্ন জৈবিক লেন্স অনুসন্ধান করতে পারেন। এটি প্রশস্ততার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে, ক্রমাগত আপডেট হওয়া টীকাগুলি ব্যবহার করে কোডিং এবং নন-কোডিং বৈশিষ্ট্য এবং হাজার হাজার জীবকে কভার করে। ফলাফলগুলি পরিপাটি, ম্যানিপুলেশন-বান্ধব কাঠামোতে ফেরত পাঠানো হয় এবং পথ, পদ এবং জিন-সেট সম্পর্কগুলিকে সংক্ষিপ্ত করার জন্য সমৃদ্ধ ভিজ্যুয়ালাইজেশন ফাংশনের (কম্প্যানিয়ন টুলিংয়ের মাধ্যমে) সাথে স্বাভাবিকভাবেই যুক্ত হয়।
বৈশিষ্ট্য
- একাধিক টীকা উৎস জুড়ে একীভূত ORA এবং GSEA কর্মপ্রবাহ
- হালনাগাদ জিন টীকা ব্যবহার করে বিস্তৃত প্রজাতির সমর্থন
- পরিপাটি আউটপুট যা ডাউনস্ট্রিম R ডেটা পাইপলাইনের সাথে পরিষ্কারভাবে সংহত করে
- সহচর প্লটিং টুলের মাধ্যমে সমৃদ্ধকরণ ফলাফলের অন্তর্নির্মিত ভিজ্যুয়ালাইজেশন
- ক্রস-কন্ডিশন বিশ্লেষণের জন্য মাল্টি-গ্রুপ তুলনা ইউটিলিটি (যেমন, তুলনা ক্লাস্টার)
- পুনরুৎপাদনযোগ্য, এন্ড-টু-এন্ড সমৃদ্ধকরণ অধ্যয়নের জন্য বিস্তারিত ভিগনেট এবং ম্যানুয়াল
প্রোগ্রামিং ভাষা
R
বিভাগ
এটি এমন একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।