এটি লিনাক্স অনলাইনে চালানোর জন্য MSL নামক লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজটি mslib-1.1.0.9.tgz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
ডাউনলোড করুন এবং অনলাইনে চালান MSL নামের এই অ্যাপটি বিনামূল্যে OnWorks-এর সাথে Linux-এ চালানোর জন্য।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
অনলাইনে লিনাক্সে চালানোর জন্য MSL
বর্ণনাঃ
MSL হল একটি C++ লাইব্রেরি যা ম্যাক্রোমলিকুলের কম্পিউটেশনাল স্টাডি সক্ষম করে।MSL লাইব্রেরি একটি প্রোগ্রাম নয় (যদিও কিছু অ্যাপ্লিকেশন বিতরণ করা হয়) কিন্তু বিজ্ঞানীদের নিজস্ব আণবিক মডেলিং পদ্ধতি কোড করার জন্য একটি টুল।
দর্শন
মূল লক্ষ্য হল এমন এক সেট টুল তৈরি করা যা ম্যাক্রোমোলিকুলের কম্পিউটেশনাল অধ্যয়নকে সমস্ত স্তরে আপেক্ষিক সহজে সক্ষম করে, সহজ অপারেশন (উদাহরণস্বরূপ, একটি PDB লোড করা এবং একটি দূরত্ব পরিমাপ করা বা একটি ডিহেড্রাল সম্পাদনা করা) থেকে জটিল অ্যাপ্লিকেশন পর্যন্ত (প্রোটিন মডেলিং বা নকশা)।
এমএসএল উইসকনসিন-ম্যাডিসন বিশ্ববিদ্যালয়ের সেনেস ল্যাবে এবং অন্যান্য গবেষণা ল্যাবরেটরির ডেভেলপার/ব্যবহারকারীদের একটি দল দ্বারা তৈরি করা হয়েছে।
রেফারেন্স:
কুলপ ডিডব্লিউ, সুব্রামানিয়াম এস, ডোনাল্ড জেই, হ্যানিগান বিটি, মুলার বিকে, গ্রিগরিয়ান জি, সেনেস এ।
একটি ওপেন সোর্স মলিকুলার সফটওয়্যার লাইব্রেরি (MSL) সহ কাঠামোগত তথ্য, মডেলিং এবং ডিজাইন।
জে কম্পিউট কেম। 2012 ভলিউম। 33 পৃষ্ঠা 1645-61
নিবন্ধ ডাউনলোড করুন http://dx.doi.org/10.1002/jcc.22968
বৈশিষ্ট্য
- গঠনমূলক পরিবর্তন এবং সাইড চেইন গঠনমূলক স্বাধীনতার রোটামেরিক উপস্থাপনার জন্য একাধিক পরমাণু স্থানাঙ্কের মধ্যে সঞ্চয় এবং পরিবর্তন করার ক্ষমতা।
- একটি অবস্থানে একাধিক অবশিষ্টাংশ পরিচয় (যেমন LEU, ILE, ALA) তৈরি এবং সংরক্ষণ করার ক্ষমতা এবং তাদের মধ্যে স্যুইচ করার ক্ষমতা।
- # CHARMM বল ক্ষেত্র এবং অন্যান্য শক্তি ফাংশন.
- রূপান্তর যেমন অনুবাদ, ঘূর্ণন, এবং প্রান্তিককরণ।
- অনুসন্ধান অ্যালগরিদম যেমন মন্টে কার্লো, ডেড এন্ড এলিমিনেশন, এবং সেল্ফ কনসিসটেন্ট মিন ফিল্ড মন্টে কার্লো।, ব্যাকবোন স্যাম্পলিং
- ক্রিস্টাল জালি প্রজন্ম।
- রোটামার লাইব্রেরির জন্য সমর্থন
- ব্যাকবোন পরিবর্তন এবং প্রজন্ম
- সমর্থিত প্ল্যাটফর্ম: লিনাক্স, ম্যাকওএস
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা
প্রোগ্রামিং ভাষা
সি ++
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/mslib/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।