এটি হল QUASR নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজটি QUASR_v6.08.tar হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
QUASR নামের এই অ্যাপটি OnWorks সহ বিনামূল্যে অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রিনশট:
QUASR
বর্ণনাঃ
QUASR হল একটি লাইটওয়েট পাইপলাইন যা ইলুমিনা, 454 এবং আয়ন টরেন্ট প্ল্যাটফর্ম থেকে পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং (NGS) ডেটা প্রক্রিয়া ও বিশ্লেষণ করার জন্য লেখা। যদিও মূলত ভাইরাল ডেটার জন্য লেখা, এটি যেকোনো NGS ডেটাসেটে কাজ করার জন্য যথেষ্ট জেনেরিক। ফাংশন অন্তর্ভুক্ত:
সদৃশ অপসারণ
ডিমাল্টিপ্লেক্সিং
প্রাইমার-অপসারণ
গুণমান নিশ্চিতকরণ (QA) গ্রাফিং
মান নিয়ন্ত্রণ (QC)
ঐক্যমত্য-প্রজন্ম
সংখ্যালঘু-ভেরিয়েন্ট নির্ধারণ
সংখ্যালঘু-ভেরিয়েন্ট গ্রাফিং
প্রধান বর্তমান সংস্করণ হল 6.X, যা Python3 এ লেখা। 7.X জাভাতে আমার পুনর্লিখন, কিন্তু এখনও কাজ চলছে। উভয়ই যতটা সম্ভব হালকা হওয়ার জন্য লেখা হয়েছে যাতে তারা ডেস্কটপ বা ল্যাপটপের পাশাপাশি একটি কম্পিউট ক্লাস্টারে ন্যূনতম মেমরি-প্রয়োজনীয়তার সাথে চলতে পারে।
QUASR এর সাথে আপনার যদি কোনো সমস্যা থাকে, তাহলে অনুগ্রহ করে README-এ দেওয়া ইমেল ঠিকানায় আমার সাথে যোগাযোগ করুন।
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
কমান্ড লাইন
প্রোগ্রামিং ভাষা
পাইথন
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/quasr/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।