এটি SnowyOwl নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশ SnowyOwl-2.0.3.tar.gz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
SnowyOwl নামের এই অ্যাপটি OnWorks সহ বিনামূল্যে অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রিনশট:
তুষার পেঁচা
বর্ণনাঃ
SnowyOwl হল একটি জিন ভবিষ্যদ্বাণী পাইপলাইন যা RNA-Seq ডেটা ব্যবহার করে হিডেন মার্কভ মডেল (HMM)-ভিত্তিক জিন ভবিষ্যদ্বাণী তৈরির জন্য প্রশিক্ষণ এবং ইঙ্গিত প্রদান করে, এবং ফলস্বরূপ মডেলগুলির মূল্যায়ন করে৷ তিনটি ছত্রাকের জিনোমে ম্যানুয়ালি কিউরেট করা জিন মডেলের সাথে এর ভবিষ্যদ্বাণীগুলির তুলনা করে পাইপলাইনটিকে বৈধ করা হয়েছে এবং স্ট্রিমলাইন করা হয়েছে এবং এর ফলাফলগুলি পূর্ববর্তী জিনের পূর্বাভাসের তুলনায় সংবেদনশীলতা এবং নির্বাচনযোগ্যতায় যথেষ্ট বৃদ্ধি দেখায়। সংবেদনশীলতা বারবার বিভিন্ন ইনপুট প্যারামিটার সহ এইচএমএম জিন ভবিষ্যদ্বাণীকারী অগাস্টাস চালানোর মাধ্যমে এবং পরিচিত প্রোটিনের সাথে সর্বোত্তম হোমোলজি এবং আরএনএ-সেক ডেটার সাথে সর্বোত্তম চুক্তি সহ মডেলগুলি বেছে নেওয়ার মাধ্যমে অর্জিত হয়। SnowyOwl সফলভাবে 26টি অভিনব ছত্রাকের জিনোমে জিনের ভবিষ্যদ্বাণী করেছে।
উচ্চ থ্রুপুট এবং কনফিগারেশনের উপর নিয়ন্ত্রণের জন্য পাইপলাইন স্থানীয়ভাবে ইনস্টল করা যেতে পারে। এটি মাঝে মাঝে ব্যবহারের জন্য একটি সুবিধাজনক ওয়েব ইন্টারফেসের মাধ্যমে একটি দূরবর্তী সার্ভারে চালানো যেতে পারে।
বৈশিষ্ট্য
- আরএনএ-সেক ডেটা ব্যবহার করে জিনের পূর্বাভাস
- উচ্চ সংবেদনশীলতা এবং নির্দিষ্টতা
- ম্যানুয়ালি কিউরেটেড জিন মডেলের সাথে পাইপলাইন সুবিন্যস্ত এবং বৈধ
- অত্যন্ত কনফিগারযোগ্য
- Ascomycete এবং basidiomycete ছত্রাকের জন্য ডিফল্ট কনফিগারেশন
- নিয়ন্ত্রণ এবং নমনীয়তার জন্য স্থানীয়ভাবে ইনস্টল করুন এবং চালান
- সুবিধার জন্য একটি ওয়েব ইন্টারফেসের মাধ্যমে দূরবর্তীভাবে চালান
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা, উন্নত শেষ ব্যবহারকারী
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
ওয়েব-ভিত্তিক, কমান্ড-লাইন, GTK+
প্রোগ্রামিং ভাষা
পাইথন, পিএইচপি
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/snowyowl/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।