bp_seqpartp – Online in der Cloud

Dies ist der Befehl bp_seqpartp, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION


bp_seqpart.pl – Nimmt eine oder mehrere Sequenzdateien und teilt sie in mehrere Ladungen auf
ausgewogene Dateien.

ANWENDUNG


bp_seqpart.pl -n [-h, -p , -F , -Ö ]

-n Anzahl der durch Partitionierung zu erstellenden Dateien
-h diese Hilfemeldung
-p Präfix für alle ausgegebenen FASTA-Dateinamen, Dateien haben die Form / #.
-f-Format der Dateien, standardmäßig FASTA, Sie können jedoch alles angeben, was von SeqIO von BioPerl unterstützt wird
-o Ausgabeverzeichnis, in dem die Split-Sequenz-Dateien gespeichert werden sollen

BESCHREIBUNG


Skript, das SeqIO umschließt, das die Partitionierung mehrerer Sequenzdateien in nahezu gleiche Dateien ermöglicht
große Teile für die spätere Parallelverarbeitung. Auch wenn Sie 10 Eingabedateien zur Ausgabe haben
Bei 10 Dateien werden die Dateien so ausgeglichen, dass sie eine ähnliche Gesamtlänge der Sequenz enthalten. Ausweise sind
ignoriert, wenn entschieden wird, wie die einzelnen Sequenzen ausgeglichen werden sollen.

Verwenden Sie bp_seqpartp online über die Dienste von onworks.net



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