Dies ist das Befehls-Fastatool, das im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
Schnellwerkzeug - Bietet a kompensieren of Werkzeuge nützlich wann arbeiten, mit SCHNELL Dateien.
BESCHREIBUNG
Dieses Programm ist Teil des MIRA-Assembler-Pakets. Fastatool bietet eine Reihe von Werkzeugen
nützlich bei der Arbeit mit FASTA-Trace-Dateien.
Ausführlichere Informationen finden Sie in der unten stehenden Dokumentation.
ZUSAMMENFASSUNG"
Schnellwerkzeug <Werkzeug Parameter>
OPTIONAL
clip Clips basiert auf der linken und rechten Seite einer FASTA-Sequenz, schreibt das Ergebnis in STDOUT.
Verwendung:
clipFASTA -l leftclip -r rightclip fastainfile
reinigen
Löscht Sequenzen mit Nicht-IUPAC-Basen oder leeren Sequenzen aus einer FASTA-Datei, schreibt
die 'überlebenden' Sequenzen in eine neue Datei. Wenn eine Qualitätsdatei angegeben ist, wird eine bereinigte
Version davon ist auch geschrieben. Die Sequenzen in den Qualitätsdateien (falls angegeben)
MUSS in der gleichen Reihenfolge wie in der Fasta-Datei sein.
Verwendung:
sanitizeFASTA fastainfile fastaoutfile [fastaqualin fastaqualoutfile]
Verwenden Sie fastatool online mit den onworks.net-Diensten