Dies ist die Linux-App namens MAF, deren neueste Version als MAF.zip heruntergeladen werden kann. Sie kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MAF mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS:
MAF
BESCHREIBUNG:
DNA- und RNA-Nukleotidsequenzen sind ein allgegenwärtiges Element aller biologischen Zellen und dienen den Zellen einerseits als umfassende Bibliothek an Fähigkeiten und andererseits als beeindruckendes Regulationssystem zur Kontrolle der Zellfunktionen. Das vorgestellte Multi-Alignment-Framework (MAF) soll Forschern eine einfache Sequenzalignment-Plattform als funktionale Vorlage bieten, die flexibel genug ist, um alle Schritte anzupassen, aber auch umfassend genug, um viele verschiedene Tools und benutzerdefinierte Parameterkombinationen zu verbinden, falls eine eingehende Analyse notwendig oder beispielsweise in Situationen mit niedriger Leserate ratsam ist. Die Plattform ermöglicht es Forschern, mehrere Sequenzaligner und weitere Vor- und Nachbearbeitungstools in flexiblen Kombinationen anzuwenden, um die subtilen bis bemerkenswerten Unterschiede zwischen verschiedenen Sequenzalignment- und Verarbeitungsalgorithmen zu analysieren, die auf dieselbe Datenbasis angewendet werden.
Zitieren Sie die folgende Veröffentlichung: https://doi.org/10.3390/mps8030065
Eigenschaften
- Gemeinsame Anwendung verschiedener Alignment-Tools am Beispiel von Bash-Skripten
- Flexible Vor- und Nachbearbeitungsschritte, erweiterbar und vollständig neu gestaltbar
- Bash-Vorlagen, die Entwicklungszeit sparen
Kategorien
Diese Anwendung ist auch unter https://sourceforge.net/projects/multialignmentframework/ verfügbar. Sie wurde in OnWorks gehostet, um die Ausführung online auf einem unserer kostenlosen Betriebssysteme zu vereinfachen.