Dies ist die Linux-App namens ProGraphMSA, deren neueste Version als ProGraphMSA-20130709.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens ProGraphMSA mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
ProGraphMSA
BESCHREIBUNG:
ProGraphMSA ist ein hochmodernes Werkzeug zur Ausrichtung mehrerer Sequenzen, das phylogenetisch sinnvolle Lückenmuster erzeugt und gleichzeitig die Robustheit beibehält, indem alternative Spleiße und Fehler im Verzweigungsmuster des Leitbaums zugelassen werden. Dies wird durch die Einbindung einer graphenbasierten Sequenzdarstellung wie in POA erreicht und mit den Vorteilen des phylogeniebewussten Algorithmus in Prank kombiniert. Außerdem berücksichtigen wir Variationen im Substitutionsmuster, indem wir geschätzte Aminosäurefrequenzen verwenden und kontextspezifische Profile wie in CS-Blast implementieren.Die neuesten Versionen von ProGraphMSA enthalten und erweitern das Ausrichtungsmodell, um das Einfügen und Löschen von Tandem-Wiederholungseinheiten zu unterstützen.
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/prographmsa/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.