Dies ist die Windows-App mit dem Namen GENIE (GEne-geNe IntEraction), die unter Windows online über Linux online ausgeführt werden kann. Die neueste Version kann als GENIE_src.tar heruntergeladen werden. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens GENIE (GEne-geNe IntEraction) herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Windows online über Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
GENIE (GEne-geNe IntEraction) zur Ausführung unter Windows online über Linux online
BESCHREIBUNG:
Gen-Gen-Interaktion in genetischen Assoziationsstudien ist rechenintensiv, wenn eine große Anzahl von SNPs beteiligt ist. Die meisten der neuesten Central Processing Units (CPUs) haben mehrere Kerne, während Graphics Processing Units (GPUs) auch Hunderte von Kernen haben und in letzter Zeit verwendet wurden, um schnellere wissenschaftliche Software zu implementieren. Derzeit gibt es jedoch keine Softwarepakete für die genetische Analyse, die es Benutzern ermöglichen, die Rechenleistung dieser Multi-Core-Geräte für die genetische Interaktionsanalyse für binäre Merkmale vollständig zu nutzen.Hier präsentieren wir ein neuartiges Softwarepaket GENIE, das die Leistung mehrerer GPU- oder CPU-Prozessorkerne nutzt, um die Interaktionsanalyse zu parallelisieren.
Zitat: Chikkagoudar, S., Wang, K. & Li, M. (2011). GENIE: ein Softwarepaket für die Gen-Gen-Interaktionsanalyse in genetischen Assoziationsstudien unter Verwendung mehrerer GPU- oder CPU-Kerne. BMC-Forschungsnotizen, 4(1), 158.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
C
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/gpugenie/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.