Dies ist die Windows-App mit dem Namen MCPerm: Monte Carlo SNP Permutation zur Ausführung in Windows Online über Linux Online, deren neueste Version als MCPerm_1.1.2.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App mit dem Namen „MCPerm: Monte Carlo SNP permutation“ herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Windows online über Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
MCPerm: Monte-Carlo-SNP-Permutation zur Ausführung unter Windows online über Linux online
BESCHREIBUNG:
MCPerm: Eine Monte-Carlo-Permutationsmethode für multiple Testkorrelation in einer Fall-Kontroll-AssoziationsstudieDer traditionelle Permutationstest (TradPerm) ist eine wichtige nicht-parametrische Analysemethode, die als Goldstandard für mehrere Testkorrekturen in Fall-Kontroll-Assoziationsstudien angesehen werden kann. Es stützt sich jedoch auf die ursprünglichen Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Genotypen und Phänotypdaten, um eine große Anzahl von zufälligen Shuffles durchzuführen, und ist daher rechenintensiv, insbesondere für genomweite Assoziationsstudien (GWAS). Um die Berechnungsgeschwindigkeit zu verbessern, ohne die Größe des TradPerm-p-Werts zu ändern, haben wir als effiziente Alternative zu TradPerm eine Monte-Carlo-Permutationsmethode (MCPerm) entwickelt.
Methoden: MCPerm muss die ursprünglichen Genotyp- und Phänotypdaten nicht mischen. Es verwendet die Monte-Carlo-Methode und verwendet eine zweistufige hypergeometrische Verteilung, um die zufällige Anzahl von Genotypen (AA, Aa und aa) in Fällen und Kontrollen zu generieren.
Programmiersprache
S / R
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mcperm/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.