drr - Online en la nube

Este es el comando drr que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.

PROGRAMA:

NOMBRE


drr: crea una radiografía reconstruida digitalmente

SINOPSIS


dr. [opciones] [en archivo]

DESCRIPCIÓN


Una radiografía reconstruida digitalmente (DRR) es una radiografía sintética que puede ser
generado a partir de una tomografía computarizada (TC). Se utiliza como imagen de referencia para
verificar la posición correcta de instalación de un paciente antes del tratamiento con radiación.

RRD USO


El programa drr que viene con plastimatch toma una imagen CT como entrada y genera una
o más imágenes de salida. La imagen de entrada está en formato MHA y las imágenes de salida se pueden
ya sea en formato pgm, pfm o raw. El uso de la línea de comando es:

Uso: drr [opciones] [infile]
Opciones:
-Un hardware O "cpu" o "cuda" (predeterminado = cpu)
-a num Genera un número de ángulos igualmente espaciados
-N ángulo Diferencia entre ángulos vecinos (en grados)
-nrm "xyz" Establece el vector normal para el panel
-vup "xyz" Establece el vector vup (hacia la fila superior) para el panel
-g "sad sid" Establece el triste, sid (en mm)
-r "rc" Establecer la resolución de salida (en píxeles)
-s scale Escala la intensidad del archivo de salida
-e Hacer un mapeo exponencial de los valores de salida
-c "rc" Establece el centro de la imagen (en píxeles)
-z "s1 s2" Establece el tamaño físico del generador de imágenes (en mm)
-w "r1 r2 c1 c2" Solo produce imágenes para pixes en la ventana (en pix)
-t outformat Selecciona el formato de salida: pgm, pfm o raw
-i algoritmo Elija el algoritmo {exacto, uniforme}
-o "o1 o2 o3" Establecer la posición del isocentro
-I infile Establecer el archivo de entrada en formato mha
-O outprefix Genera archivos de salida usando el prefijo especificado

El programa drr se puede utilizar en soltero imagen modo or rotacional modo. En soltero
modo de imagen, especifica la geometría completa de la fuente de rayos X y el panel de imágenes para un
imagen única. En el modo rotacional, se supone que la geometría de la imagen es

Las opciones de la línea de comandos se describen con más detalle a continuación.

-A hardware
Elija el modo de subprocesamiento, que es "cpu" o "cuda". El valor predeterminado es
"UPC".

Cuando se usa hardware de CPU, la generación de DRR usa OpenMP para aceleración multinúcleo si
su compilador admite esto. Gcc y Microsoft Visual Studio Professional
Los compiladores admiten OpenMP, pero Microsoft Visual Studio Express no.

En el momento actual, la aceleración cuda no está funcionando.

-a número Genera num ángulos igualmente espaciados

-r "r1 r2 "
Configure la resolución del panel de imágenes (en píxeles). Aquí, r1 se refiere al número
de filas y r2 se refiere al número de columnas.

SOLTERO IMAGEN MODO


El siguiente ejemplo ilustra el uso del modo de imagen única:

drr-nrm "1 0 0"
-vup "0 0 1"
-g "1000 1500"
-r "1024 768"
-z "400 300"
-c "383.5 511.5"
-o "0 -20 -50"
archivo_entrada.mha

En el ejemplo anterior, el isocentro se elige para ser (0, -20, -50), la ubicación marcada en
la imagen de TC. La orientación de la imagen de proyección está controlada por el No y vup
opciones. El uso de los valores predeterminados de (1, 0, 0) y (0, 0, 1) produce la RRD que se muestra en la
derecha: [imagen] [imagen]

Al cambiar la dirección normal (No), podemos elegir una dirección de haz diferente dentro de un
órbita isocéntrica. Por ejemplo, una RRD anteroposterior (AP) se genera con una
de (0, -1, 0) como se muestra a continuación: [imagen]

La rotación del panel de imágenes se selecciona mediante el vup opción. El valor predeterminado de
vup es (0, 0, 1), lo que significa que la parte superior del panel está orientada hacia el z positivo
dirección en coordenadas mundiales. Si quisiéramos rotar el panel 45 grados
en sentido antihorario en nuestra vista AP, estableceríamos vup a la dirección (1, 0, 1), como se muestra en
la imagen de abajo. Tenga en cuenta que vup no tiene que estar normalizado. [imagen]

ROTACIONAL MODO


En el modo rotativo, se crean varias imágenes. Se supone que la fuente y el panel de imágenes
para rotar en una órbita circular alrededor del isocentro. La órbita circular se realiza
alrededor del eje Z, y las imágenes se generan cada -N ang grados de la órbita. Esta
se ilustra con el siguiente ejemplo:

drr -N 20
-un 18
-g "1000 1500"
-r "1024 768"
-z "400 300"
-o "0 -20 -50"
archivo_entrada.mha

En el ejemplo anterior, se generan 18 imágenes en un intervalo de 20 grados, de la siguiente manera: [imagen]

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