Este es el comando fastaq-to_fasta que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
fastaq_to_fasta: convierte una variedad de formatos de entrada a un formato FASTA con un formato agradable
DESCRIPCIÓN
uso: fastaq_to_fasta [opciones]
Convierte una variedad de formatos de entrada a un formato FASTA con un formato agradable
posicional argumentos:
infile Nombre del archivo de entrada. Puede ser cualquiera de FASTA, FASTQ, GFF3, EMBL, GBK, Phylip
archivar
Nombre del archivo de salida
opcional argumentos:
-h, --ayuda
mostrar este mensaje de ayuda y salir
-l LONGITUD DE LA LÍNEA, --Longitud de la línea LONGITUD DE LA LÍNEA
Número de bases en cada línea de secuencia del archivo de salida. Poner a cero para no
saltos de línea en secuencias [60]
-s, --strip_after_whitespace
Eliminar todo después del primer espacio en blanco en cada nombre de secuencia
-u, --check_unique
Muere si alguno de los nombres de secuencia de salida no es único
Use fastaq-to_fasta en línea usando los servicios de onworks.net