Este es el comando khmer que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
khmer - k-mer contando, filtrado y recorrido de gráfico FTW!
khmer es una biblioteca y un juego de herramientas para realizar transformaciones y análisis de conjuntos de datos basados en k-mer
SINOPSIS
khmer [opciones] args
p.ej.
khmer carga en conteo -x 1e8 -k 20 lecturas.ct lecturas.fa.gz
USO
Esta página de manual solo describe khmer script de envoltura. Para conocer el software y
cómo usarlo, consulte / usr / share / doc / khmer o de lo contrario http://khmer.readthedocs.org/.
En Debian / Ubuntu, los mantenedores de paquetes evitan colocar grandes colecciones de scripts directamente
en el sistema PATH. Por el contrario, se utiliza un único script de envoltura para iniciar el script que
quiere usar; por lo tanto, si las instrucciones khmer dicen que se ejecute cargar-en-contar.py
...lo que... necesitas prefijar este comando con khmer. Además, la extensión .py
puede omitirse, lo que da como resultado un comando del formato que se muestra arriba.
Si no le gusta esto, simplemente agregue / usr / lib / khmer / bin a su PATH personal.
Utilice khmer en línea utilizando los servicios de onworks.net