Este es el comando makemat que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
makemat: convierte perfiles binarios en formato ASCII portátil
SINOPSIS
maquillar [-] [-E N] [-G N] [-H] [-P nombre de archivo] [-S X] [-U str] [-d str] [-z N]
DESCRIPCIÓN
maquillar convierte una colección de perfiles binarios, creado por el -C opción de PSI-BLAST,
en formato ASCII portátil.
OPCIONES
Un resumen de las opciones se incluye a continuación.
- Mensaje de uso de impresión
-E N Costo para ampliar una brecha (predeterminado = 1)
-G N Costo para abrir una brecha (predeterminado = 11)
-H Ayuda de impresión; anula todos los demás argumentos
-P nombre de archivo
Nombre de la base de datos para la base de datos de perfiles (predeterminado = stdin)
-S X Factor de escala para salidas matriciales para evitar problemas de redondeo (predeterminado = 100)
-U str Matriz subyacente (predeterminado = BLOSUM62)
-d str Base de datos de secuencia subyacente utilizada para hacer perfiles (predeterminado = nr)
-z N Longitud efectiva de la base de datos de perfiles (0 para la longitud de -d opción)
Use Makemat en línea usando los servicios de onworks.net