Esta es la aplicación para Linux AlphaFold 3, cuya última versión se puede descargar como AlphaFoldv3.0.1sourcecode.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada AlphaFold 3 con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CAPTURAS DE PANTALLA:
AlfaFold 3
DESCRIPCIÓN:
AlphaFold 3, desarrollado por Google DeepMind, es un sistema avanzado de aprendizaje profundo para predecir estructuras e interacciones biomoleculares con una precisión excepcional. Este repositorio proporciona el proceso de inferencia completo para ejecutar AlphaFold 3, aunque el acceso a los parámetros del modelo es restringido y debe obtenerse directamente de Google bajo condiciones de uso específicas. El sistema está diseñado para aplicaciones de investigación científica en biología estructural, bioquímica y bioinformática, lo que permite el modelado preciso de proteínas, ligandos y modificaciones covalentes. Los usuarios pueden realizar predicciones locales mediante contenedores Docker, integrando el proceso de inferencia de AlphaFold 3 con las configuraciones de entrada JSON proporcionadas. El software incluye opciones flexibles para ejecutar tanto el preprocesamiento de datos como la inferencia acelerada por GPU, lo que permite a los usuarios adaptarse a los recursos computacionales disponibles.
Caracteristicas
- Implementa la canalización de inferencia completa de AlphaFold 3 para la predicción de estructuras
- Admite preprocesamiento de datos basado en CPU y modos de inferencia acelerados por GPU
- Entorno basado en Docker para una implementación y reproducibilidad simplificadas
- Configuración de entrada basada en JSON para tareas de predicción personalizables
- Diseñado para modelado de estructura e interacción biomolecular
- Amplia documentación sobre instalación, formatos de entrada/salida y problemas conocidos
Lenguaje de programación
C ++, Python
Categorías
Esta aplicación también se puede descargar desde https://sourceforge.net/projects/alphafold-3.mirror/. Está alojada en OnWorks para facilitar su ejecución en línea desde uno de nuestros sistemas operativos gratuitos.