Esta es la aplicación para Linux llamada BioEmu, cuya última versión se puede descargar como 0.1.12sourcecode.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada BioEmu con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CAPTURAS DE PANTALLA:
BioEmu
DESCRIPCIÓN:
El Emulador Biomolecular (BioEmu) es un modelo que toma muestras de la distribución aproximada de equilibrio de las estructuras de un monómero proteico, dada su secuencia de aminoácidos. Por defecto, se filtran las estructuras no físicas (choques estéricos o discontinuidades de cadena), por lo que normalmente se obtendrán menos muestras en el resultado de las solicitadas. La diferencia puede ser muy grande si la proteína presenta grandes regiones desordenadas, que son muy propensas a producir choques. BioEmu genera las estructuras en representación de la estructura principal. Para reconstruir las cadenas laterales, existen varias herramientas disponibles. Por ejemplo, interactuamos con HPacker para realizar la reconstrucción de cadenas laterales y también proporcionamos herramientas básicas para ejecutar un breve equilibro de dinámica molecular (MD).
Caracteristicas
- Reconstrucción de la cadena lateral y relajación MD
- Código de terceros
- Fundición de IA de Azure
- Reproducir resultados de la preimpresión
- Estructuras de muestreo
- BioEmu se proporciona como un paquete instalable mediante pip solo para Linux
Lenguaje de programación
Python
Categorías
Esta aplicación también se puede descargar desde https://sourceforge.net/projects/bioemu.mirror/. Está alojada en OnWorks para facilitar su ejecución en línea desde uno de nuestros sistemas operativos gratuitos.