Esta es la aplicación para Linux llamada MAF, cuya última versión se puede descargar como MAF.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MAF con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CAPTURAS DE PANTALLA:
MAF
DESCRIPCIÓN:
Las secuencias de nucleótidos de ADN y ARN son un elemento omnipresente en todas las células biológicas y sirven, por un lado, como una biblioteca completa de capacidades para las células y, por otro, como un sistema regulador excepcional para controlar la función celular. El marco de alineamiento múltiple (MAF) presentado debería proporcionar a los investigadores una plataforma sencilla de alineamiento de secuencias como plantilla funcional, lo suficientemente flexible como para ajustar todos los pasos, pero también lo suficientemente completa como para integrar diversas herramientas y combinaciones de parámetros personalizados si se requiere o se recomienda un análisis exhaustivo, por ejemplo, en situaciones de baja tasa de lectura. La plataforma permite al investigador aplicar múltiples alineadores de secuencias y otras herramientas de preprocesamiento y posprocesamiento en combinaciones flexibles para analizar las diferencias, desde sutiles hasta notables, entre los diferentes algoritmos de alineamiento y procesamiento de secuencias aplicados a la misma base de datos.
Cite la siguiente publicación: https://doi.org/10.3390/mps8030065
Caracteristicas
- Aplicación conjunta de diferentes herramientas de alineación ejemplificadas por scripts bash
- Pasos de preprocesamiento y posprocesamiento flexibles, ampliables y completamente rediseñables
- Plantillas Bash que ahorran tiempo de desarrollo
Categorías
Esta aplicación también se puede descargar desde https://sourceforge.net/projects/multialignmentframework/. Está alojada en OnWorks para facilitar su ejecución en línea desde uno de nuestros sistemas operativos gratuitos.