Esta es la aplicación de Linux llamada PINCIS cuya última versión se puede descargar como PINCIS_v12.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada PINCIS con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CAPTURAS DE PANTALLA:
PINCIS
DESCRIPCIÓN:
PINCIS.pl (PIcs N-/C-terminal Inferred Substrates perl script) es una pequeña herramienta de línea de comandos para designar y analizar datos PICS (Schilling et al., Nat. Protocols, 2011) para obtener el sitio principal y no principal especificidad de las proteasas. Por lo tanto, el script filtra las listas de péptidos dadas para los péptidos de la biblioteca (generados por la proteasa de digestión en el flujo de trabajo de proteómica en lugar de la proteasa de interés) e imprime listas de extensiones de ventana de escisión N- y C-terminal inferidas que se pueden usar simultáneamente para generar visualizaciones de especificidad de división como iceLogo (https://iomics.ugent.be/icelogoserver/create).
Caracteristicas
- Análisis de datos PICS
- Determinación de la ventana de división
Audiencia
Otra audiencia
Lenguaje de programación
Perl
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/pincis/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.