Esta es la aplicación de Linux llamada Protein Cavity Search, cuya última versión se puede descargar como cavidad-search-0.21.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Protein Cavity Search con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
Búsqueda de cavidades de proteínas
DESCRIPCIÓN:
Software para identificar cavidades y hendiduras en proteínas. El objetivo es poder tomar una estructura de proteína y diferenciar entre cinco tipos diferentes de ambientes para cada residuo: enterrado, superficial, interfacial, cavidad o hendidura.
Caracteristicas
- Calcular volúmenes de cavidades internas
- Determinar el ambiente de residuos ionizables.
- Calcular la profundidad de enterramiento de residuos ionizables
- Calcular la densidad de empaquetamiento para residuos ionizables
Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Python
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/cavity-search/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.