Esta es la aplicación de Linux llamada qure cuya última versión se puede descargar como QuRe_v0.99971.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada qure con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CAPTURAS DE PANTALLA:
cure
DESCRIPCIÓN:
QuRe es un programa para la reconstrucción de cuasiespecies virales, desarrollado específicamente para analizar datos NGS de lectura larga (> 100 pb). El software realiza alineaciones de fragmentos de secuencia contra un genoma de referencia, encuentra una división óptima del genoma en ventanas deslizantes basadas en la cobertura y la diversidad e intenta reconstruir todas las secuencias individuales de la cuasiespecie viral, junto con su prevalencia, utilizando un método heurístico. algoritmo, que coincide con distribuciones multinomiales de distintas variantes virales que se superponen a lo largo de la división del genoma. QuRe viene con un método de corrección de errores de Poisson incorporado y un agrupamiento probabilístico posterior a la reconstrucción, ambos parametrizados en tasas de error dadas en regiones homopoliméricas y no homopoliméricas.Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/qure/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.