Esta es la aplicación de Windows llamada Alphafold cuya última versión se puede descargar como Alphafoldv2.3.2.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Alphafold con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
CAPTURAS DE PANTALLA:
Alfafold
DESCRIPCIÓN:
Este paquete proporciona una implementación de la canalización de inferencia de AlphaFold v2.0. Este es un modelo completamente nuevo que se ingresó en CASP14 y se publicó en Nature. Para simplificar, nos referimos a este modelo como AlphaFold en el resto de este documento. Cualquier publicación que revele los hallazgos derivados del uso de este código fuente o los parámetros del modelo debe citar el artículo de AlphaFold. Consulte también la Información complementaria para obtener una descripción detallada del método. Puede usar una versión ligeramente simplificada de AlphaFold con este cuaderno Colab o versiones respaldadas por la comunidad. El tamaño total de descarga para las bases de datos completas es de alrededor de 415 GB y el tamaño total cuando se descomprime es de 2.2 TB. Asegúrese de tener suficiente espacio en el disco duro, ancho de banda y tiempo para descargar. Recomendamos utilizar un SSD para un mejor rendimiento de la búsqueda genética.
Caracteristicas
- AlphaFold necesita múltiples bases de datos genéticas (secuencia) para funcionar
- Si bien el código AlphaFold tiene la licencia Apache 2.0, los parámetros AlphaFold están disponibles para uso no comercial
- 5 modelos que se utilizaron durante CASP14 y fueron ampliamente validados para la calidad de predicción de estructuras
- 5 modelos pTM, que fueron ajustados para producir pTM
- La forma más sencilla de ejecutar AlphaFold es utilizando el script de Docker proporcionado
- De forma predeterminada, Alphafold intentará utilizar todos los dispositivos GPU visibles
Lenguaje de programación
Python
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/alphafold.mirror/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.