Esta es la aplicación de Windows llamada MCPerm: permutación Monte Carlo SNP para ejecutarse en Windows en línea sobre Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como MCPerm_1.1.2.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MCPerm: permutación Monte Carlo SNP para ejecutarse en Windows en línea sobre Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
MCPerm: permutación Monte Carlo SNP para ejecutarse en Windows en línea sobre Linux en línea
DESCRIPCIÓN:
MCPerm: un método de permutación de Monte Carlo para la correlación de pruebas múltiples en un estudio de asociación de casos y controlesLa prueba de permutación tradicional (TradPerm) es un importante método de análisis no paramétrico que puede tratarse como el estándar de oro para múltiples correcciones de prueba en el estudio de asociación de casos y controles. Sin embargo, se basa en los datos originales de genotipos y fenotipos del polimorfismo de nucleótido único (SNP) para realizar una gran cantidad de reordenamientos aleatorios y, por lo tanto, es computacionalmente intensivo, especialmente para el estudio de asociación de todo el genoma (GWAS). Para mejorar la velocidad de cálculo sin cambiar el tamaño del valor p de TradPerm, desarrollamos un método de permutación de Monte Carlo (MCPerm) como una alternativa eficiente a TradPerm.
Métodos: MCPerm no necesita mezclar los datos de genotipos y fenotipos originales. Utiliza el método de Monte Carlo, emplea una distribución hipergeométrica de dos pasos para generar el número aleatorio de genotipos (AA, Aa y aa) en casos y controles.
Lenguaje de programación
B / R
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/mcperm/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.