Esta es la aplicación de Windows llamada Splicing Prediction Pipeline cuya última versión se puede descargar como SPiP_alone_v2_1.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Splicing Prediction Pipeline con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
CAPTURAS DE PANTALLA:
Canalización de predicción de empalmes
DESCRIPCIÓN:
SPiP es una herramienta para predecir la alteración del empalme de la variante mediante la integración de varias herramientas de predicción en una tubería global.
/! \ para la versión de Windows, todas las puntuaciones de SPiP se calculan entre la versión 2.0 y 2.1 antes de que la corrección sea INCORRECTA, utilice la versión 2.1 corregida o una versión posterior. Para la versión de Linux, las puntuaciones de SPiP son correctas.
También puede descargar SPiP en formato zip: https://sourceforge.net/projects/splicing-prediction-pipeline/files/SPiP_alone_v2_0.zip
Para Linux (GitHub): https://github.com/raphaelleman/SPiP
Si tiene alguna pregunta, comuníquese conmigo para: r.leman@baclesse.unicancer.fr or raphael.leman@orange.fr
v2.1 corregido (07/2021):
corrección del cálculo de la puntuación
v2.1 (06/2021):
Más estricto en "Alterar por evento complejo"
v2.0 (04/2021):
Nuevo SPiP con modelización aleatoria de bosques
cambio antiguo detallado en https://sourceforge.net/projects/splicing-prediction-pipeline/files/changeLogBeforev2.0.txt
Interfaz de usuario
Tk
Lenguaje de programación
B / R
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/splicing-prediction-pipeline/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.