این دستور bp_hmmer_to_tablep است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
bp_hmmer_to_table - خروجی HMMER را به فرمت جدولی تبدیل کنید
خلاصه
bp_hmmer_to_table [-e evaluefilter] [-b bitscorefilter] [--header] [-o outfile] inputfile1 inputfile2 ...
شرح
گزینه های خط فرمان:
-e/--evalue evalue -- فیلتر به ارزش
-b/--bitscore bitscore -- فیلتر به امتیاز بیت
--header -- پرچم بولی برای چاپ هدر ستون
-o/--out - فایل خروجی اختیاری برای نوشتن داده،
در غیر این صورت به STDOUT می نویسد
-h/--help -- این مستندات را نشان دهید
از نظر فنی یک اسکریپت SearchIO نیست زیرا از هیچ مولفه Bioperl استفاده نمی کند اما یک اسکریپت است
مفید و سریع خروجی خروجی جدولی است.
دنباله پرس و جو / دامنه (اینها برای hmmsearch / hmmpfam فلیپ فلاپ می شوند)
شروع پرس و جو
پایان پرس و جو
نام دامنه/توالی یا الحاق PFAM
استارت بزنید
ضربه پایان
نمره
ارزش الکترونیکی
نام دامنه/توالی (اینها برای hmmsearch / hmmpfam فلیپ فلاپ می شوند)
نویسنده - جیسون استاجیچ
جیسون استاجیچ jason_at_bioperl-dot-org
با استفاده از خدمات onworks.net از bp_hmmer_to_tablep به صورت آنلاین استفاده کنید