این دستور libscanoute است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
libscanout - یک فایل DHF را می خواند و یک فایل از کلاس های با امتیاز بالا، تا کردن و نوشتن می نویسد.
سوپرخانواده ها
خلاصه
libscanout -dhfinfile پرونده -outfile مجموعه
libscanout -کمک
شرح
libscanout یک برنامه خط فرمان از EMBOSS ("European Molecular Biology Open
بسته نرم افزاری"). این بخشی از گروه(های) فرمان "Protein: 3D Structure" است.
OPTIONS
ورودی بخش
-dhfinfile پرونده
این گزینه محل فایل DHF (فایل بازدید دامنه) (ورودی) را مشخص می کند. آ
'فایل بازدیدهای دامنه' حاوی بازدیدهای پایگاه داده (توالی) با طبقه بندی دامنه است
اطلاعات در قالب های FASTA یا EMBL. بازدیدها مربوط به خانواده SCOP یا CATH هستند
و از جستجوی یک پایگاه داده توالی پیدا می شوند. فایل های حاوی بازدیدهای بازیابی شده توسط
PSIBLAST با استفاده از SEQSEARCH تولید می شود.
ضروری بخش
تولید بخش
-outfile مجموعه
این گزینه محل فایل خلاصه (خروجی) را مشخص می کند. فایل خلاصه
شامل لیستی از کلاس های دامنه، سوپرخانواده ها و خانواده ها است که بر اساس رتبه بندی شده اند
از امتیاز (بالاترین امتیاز اول).
از libscanoute آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید