این دستور ltrsift است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
ltrsift - یک رابط گرافیکی برای پس پردازش و طبقه بندی LTR
کاندیدهای رتروترانسپوزون
خلاصه
ltrsift
شرح
LTRsift یک ابزار دسکتاپ گرافیکی برای پس پردازش نیمه خودکار De novo پیش بینی شده است.
حاشیه نویسی رتروترانسپوزون LTR، مانند آنهایی که توسط LTRharvest و LTRdigest ایجاد شده است.
پیکربندی
باینری های LAST (lastal و lastdb) باید در مسیر جستجوی سیستم قرار گیرند. اگر آنها
نیست، آیا می توان مکان آنها را با استفاده از محیط "GT_LAST_PATH" مشخص کرد
متغیر قبل از اجرای LTRsift. همین امر برای مکان BLAST نیز صدق می کند. استفاده کنید
"GT_BLAST_PATH" برای تعیین مسیر کامل به فایل اجرایی "blastall".
فایل های سبک (توضیح می دهد که چگونه نمودار خطی ویژگی های نامزد به نظر می رسد) می تواند باشد
از طریق متغیر محیطی LTRSIFT_STYLE_FILE تنظیم کنید. یک سبک پیش فرض معقول ساخته شده است
به LTRsift.
با استفاده از خدمات onworks.net از ltrsift آنلاین استفاده کنید