این برنامه لینوکس با نام ArtificialFastqGenerator است که آخرین نسخه آن را می توان با نام ArtificialFastqGenerator_19_05_2015.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام ArtificialFastqGenerator را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
ArtificialFastq Generator
DESCRIPTION:
ArtificialFastqGenerator ژنوم مرجع (در فرمت FASTA) را به عنوان ورودی می گیرد و فایل های FASTQ مصنوعی را با فرمت Sanger خروجی می دهد. می تواند امتیازهای کیفیت پایه Phred را از فایل های FASTQ موجود بپذیرد و از آنها برای شبیه سازی خطاهای توالی استفاده کند. از آنجایی که FASTQ های مصنوعی از ژنوم مرجع مشتق شده اند، ژنوم مرجع استاندارد طلایی برای فراخوانی انواع (چند شکلی های تک نوکلئوتیدی (SNPs) و درج ها و حذف ها (indels)) ارائه می دهد. این امکان ارزیابی خط لوله تجزیه و تحلیل توالی نسل بعدی (NGS) را فراهم می کند که قرائت ها را با ژنوم مرجع تراز می کند و سپس انواع را فراخوانی می کند.مخاطبان
صنعت مراقبت های بهداشتی، علم/تحقیق، کاربران نهایی پیشرفته
زبان برنامه نویسی
جاوه
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/artfastqgen/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.