این برنامه لینوکس با نام CSBB-v2.1 [CSBB-v3.0 اکنون در دسترس است] است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان CSBB-v3.0.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه را با نام CSBB-v2.1 [CSBB-v3.0 اکنون در دسترس است] با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
اسکرین شات ها:
CSBB-v2.1 [CSBB-v3.0 اکنون در دسترس است]
DESCRIPTION:
CSBB یک مجموعه بیوانفورماتیک مبتنی بر خط فرمان برای تجزیه و تحلیل داده‌های بیولوژیکی به‌دست‌آمده از راه‌های مختلف آزمایش‌های بیولوژیکی است. CSBB در Perl پیاده سازی شده است، در حالی که از R، java و ruby در پس زمینه برای ماژول های خاص نیز استفاده می کند. تمرکز اصلی CSBB این است که به کاربرانی از جامعه زیست شناسی و بیوانفورماتیک اجازه دهد تا با انجام وظایف تجزیه و تحلیل پایین دستی و در عین حال حذف نیاز به نوشتن کد برنامه نویسی، از آنها بهره مند شوند. CSBB در حال حاضر بر روی پلتفرم های لینوکس، یونیکس و ویندوز در دسترس است.
در حال حاضر CSBB 17 ماژول متمرکز بر وظایف تحلیلی مانند عادی سازی، تجسم، آمار، RNA-SEQ و غیره را ارائه می دهد.
امکانات
- RNA-SEQ
- بیان دیفرانسیل
- تجسم تعاملی
- آمار
- تعامل پروتئین پروتئین
- عادی سازی
- سایر نرم افزارها
- متن باز
- استفاده عمومی عمومی
مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
خط فرمان
زبان برنامه نویسی
پرل
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/csbb-v2-1/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.