این برنامه لینوکس با نام datasw است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان datasw-win64.exe دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام datasw را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
اسکرین شات ها:
datasw
DESCRIPTION:
پراکندگی پرتو ایکس با زاویه کوچک (SAXS) در محلول یک روش رایج با وضوح پایین است که می تواند به طور موثر اطلاعات با وضوح بالا به دست آمده توسط کریستالوگرافی یا NMR را تکمیل کند. تک پراکندگی نمونه کلیدی برای تفسیر داده های SAXS قابل اعتماد و ساخت مدل است. تنظیمات Beamline با کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا (HPLC) به ویژه برای پروفایل دقیق نمونه‌های ناهمگن مفید هستند. برنامه DATASW با استفاده از یک پنجره کشویی با اندازه مشخص شده توسط کاربر، میانگین‌گیری فریم‌های داده منفرد را از آزمایش HPLC-SAXS انجام می‌دهد، پارامترهای کلی (I(0)، Rg، Dmax و MW) را محاسبه می‌کند و حالت تاشو (تاشده/بازشده) را پیش‌بینی می‌کند. از نمونه کاربردهای DATASW برای چندین پروتئین با رفتارهای الیگومریزاسیون مختلف ثبت شده در خطوط پرتوهای مختلف نشان داده شده است.
اگر از DATASW در کار خود استفاده می کنید، لطفاً ذکر کنید:
Shkumatov AV & Strelkov SV (2015) Acta Cryst. D71، 1347–1350
امکانات
- تفریق بافر
- میانگین قاب با استفاده از پنجره کشویی با اندازه مشخص شده توسط کاربر
- محاسبه Rg, I0, Dmax با استفاده از تقریب گینیر یا تبدیل فوریه غیر مستقیم
- تخمین وزن مولکولی با استفاده از حجم پورود، حجم همبستگی و SAXS MoW
- تشخیص اوج (ها)
- نمودار نتایج به صورت تعاملی با محدودیت های محورهای مختلف است
- نمودار کراتکی بدون بعد برای نمونه و دو پروتئین مرجع (BSA و hTau40wt باز شده)
- میانگین گیری تعاملی فریم های داده و عادی سازی نمودار کراتکی بدون بعد
مخاطبان
علم/تحقیق، آموزش
رابط کاربری
خط فرمان
زبان برنامه نویسی
پرل
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/datasw/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.