این برنامه لینوکس به نام isiKnock برای اجرای آنلاین در لینوکس است که آخرین نسخه آن را می توان با نام isiKnockv1.0.0.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه به نام isiKnock را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت آنلاین با OnWorks در لینوکس اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
اسکرین شات ها:
isiKnock برای اجرای آنلاین در لینوکس
DESCRIPTION:
مسیرهای سیگنالینگ فرآیندهای پیچیده و درهم تنیده ای هستند. آشفتگی سیستم‌های بیولوژیکی می‌تواند تأثیر متقابل و وابستگی‌های پیچیده اجزای مسیر را آشکار کند.isiKnock نرم افزاری برای هدایت و تجسم خودکار ناک اوت های سیلیکونی برای مسیرهای سیگنالینگ است (Hannig et al. 2019). isiKnock رفتار ناک اوت را بر اساس محاسبه جریان سیگنال در حالت ثابت پیش بینی می کند. برای توضیح مفهوم ناک اوت در سیلیکون، به Scheidel et al. 2016 و آمشتاین و همکاران. 2017.
هانیگ و همکاران (2019) isiKnock: در ناک اوت های سیلیکونی در مسیرهای سیگنالینگ، بیوانفورماتیک، 35(5)، 892-894
آمشتاین و همکاران (2017) متغیرهای Manatee مسیرهای عملکردی را در شبکه های سیگنالینگ نشان می دهند. بیولوژی سیستم های BMC، 11(1)، 72.
شیدل و همکاران (2016) در مطالعات حذفی سیلیکونی از گرفتن بیگانه خواری سالمونلا. زیست شناسی محاسباتی PLoS، 12(12)، e1005200.
امکانات
- زیستشناسی سیستم
- در ناک اوت سیلیکونی
- آشفتگی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/molbi-isiknock/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.