این برنامه لینوکس با نام MPprimer است که آخرین نسخه آن را می توان با نام MPprimer-1.5-macOS-64.tar.bz2 دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام MPprimer را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
MPprimer
DESCRIPTION:
زمینه و هدف: Multiplex PCR، که به عنوان تقویت همزمان چندین ناحیه از یک الگوی DNA با استفاده از بیش از یک مجموعه پرایمر (شامل یک پرایمر رو به جلو و یک پرایمر معکوس) در یک لوله تعریف می شود، به طور گسترده در مطالعات میکروبیولوژی بالینی و محیطی استفاده شده است. با این حال، طراحی پرایمر برای Multiplex PCR هنوز یک مشکل چالش برانگیز است و چندین فاکتور باید در نظر گرفته شود. این مشکلات عبارتند از پرایمینگ نادرست به دلیل اتصال غیر اختصاصی به قالب های DNA غیر هدف، دایمر شدن پرایمر و ناتوانی در جداسازی و خالص سازی آمپلیکون های DNA با تحرک الکتروفورتیک مشابه.
نتایج: یک برنامه جدید به نام MPprimer برای کمک به کاربران در طراحی مجموعه های پرایمر برای Multiplex PCR با قابلیت اطمینان بالا ایجاد شد. این برنامه از برنامه طراحی پرایمر پرمصرف Primer3 و برنامه ارزیابی ویژگی پرایمر MFEprimer برای طراحی و ارزیابی پرایمرهای کاندید بر اساس پایگاه داده DNA ژنومی یا رونوشت، و پس از بررسی دقیق برای جلوگیری از دایمر شدن پرایمر استفاده می کند.
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/mpprimer/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.