این برنامه لینوکس با نام PPIXpress است که آخرین نسخه آن را می توان با نام PPIXpress_1.23.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام PPIXpress را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
اسکرین شات ها:
PPIXpress
DESCRIPTION:
اگرچه شبکه‌های برهمکنش پروتئین-پروتئین جزء همه‌جای زیست‌شناسی سیستم‌های مدرن هستند، تلاش‌های نسبتا کمی برای تنظیم توپولوژی آن‌ها با شرایط سلولی واقعی مورد مطالعه انجام شده است. از آنجایی که کاهش ساده شبکه‌ها به زیرمجموعه ژن‌های بیان‌شده فقط سطح قابلیت‌های تنظیمی ارگانیسم‌های بالاتر را خراش می‌دهد، ما روش پیشرفته PPIXpress را پیشنهاد می‌کنیم که امکان بهره‌برداری از داده‌های بیان را در سطح رونوشت فراهم می‌کند و بنابراین می‌تواند تغییرات را نیز آشکار کند. اتصال پروتئین ناشی از اتصال جایگزین
انتشار اصلی را می توان در https://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/32/4/571 .
امکانات
- ساخت خودکار شبکه های تعامل پروتئین-پروتئین
مخاطبان
صنعت بهداشت و درمان، علم/تحقیق
رابط کاربری
جاوا Swing، کنسول/ترمینال، خط فرمان
زبان برنامه نویسی
جاوه
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/ppixpress/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.