این برنامه لینوکس به نام ProGraphMSA است که آخرین نسخه آن را می توان با نام ProGraphMSA-20130709.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام ProGraphMSA را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
ProGraphMSA
DESCRIPTION:
ProGraphMSA یک ابزار پیشرفته تراز چند توالی است که با ایجاد اتصالات و خطاهای جایگزین در الگوی انشعاب درخت راهنما، الگوهای شکاف معقول فیلوژنتیکی را ایجاد می کند و در عین حال استحکام را حفظ می کند. این امر با ترکیب یک نمایش توالی مبتنی بر نمودار مانند POA و ترکیب آن با مزایای الگوریتم فیلوژنی-آگاه در Prank به دست می‌آید. علاوه بر این، ما تغییرات در الگوی جایگزینی را با استفاده از فرکانس‌های تخمینی اسید آمینه و با اجرای پروفایل‌های خاص زمینه مانند CS-Blast در نظر می‌گیریم.آخرین نسخه‌های ProGraphMSA شامل و توسعه مدل همترازی برای پشتیبانی از درج و حذف واحد تکرار پشت سر هم می‌شود.
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/prographmsa/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.