Il s'agit de la commande bp_multi_hmmsearch.plp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
multi_hmmsearch - effectuez une recherche hmm dans plusieurs fichiers FASTA en utilisant
un fichier INDEX
SYNOPSIS
multi_hmmsearch -p fichier_hmm [-i] -f fichier_index
DESCRIPTION
Techniquement pas un script Bio::Tools::Run car il n'utilise aucun Bioperl ou Bioperl-run
composants mais c'est utile.
Obligatoire Options:
-p Profil HMM à utiliser pour la recherche.
-f Fichier INDEX qui contient une liste de fichiers FASTA pour les multiples
chercher.
# Options:
-i Crée un nouveau fichier d'index avec les fichiers hmms résultants. C'est
utile si vous voulez passer cette liste comme arguments d'entrée dans
un autre programme.
-h Affiche cette documentation.
RETOURS
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Utilisez bp_multi_hmmsearch.plp en ligne à l'aide des services onworks.net