Il s'agit de la commande bp_run_neighbor.plp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
run_neighbor - exécute le programme "voisin" de Phylip via Bioperl
SYNOPSIS
run_neighbor [-i fichier_entrée] [-o nom_fichier_sortie]
DESCRIPTION
Fournissez un fichier de matrice sur lequel exécuter le voisin. Le fichier doit être nommé du format file.matrix
ou file.protdist (la fin n'a pas d'importance, mais le programme attend un fichier sous la forme de
(\S+)\.(\S+).
Cela exécutera l'application 'neighbor' pour construire un arbre Neighbor-Joining à partir d'une protéine
matrice de distance.
Utilisez bp_run_neighbor.plp en ligne à l'aide des services onworks.net