bp_seqpartp - En ligne dans le Cloud

Il s'agit de la commande bp_seqpartp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

PROGRAMME:

Nom


bp_seqpart.pl - Prend un ou plusieurs fichiers de séquence et les divise en un certain nombre de charges
fichiers équilibrés.

UTILISATION


bp_seqpart.pl -n [-h, -p , -F , -o ]

-n nombre de fichiers à créer via le partitionnement
-h ce message d'aide
-p préfixe pour tous les noms de fichiers FASTA en sortie, les fichiers sont de la forme / #.
-f format des fichiers, par défaut FASTA mais vous pouvez spécifier tout ce qui est pris en charge par SeqIO à partir de BioPerl
-o répertoire de sortie où vider les fichiers de séquence divisés

DESCRIPTION


Script wrapping SeqIO qui permet le partitionnement de plusieurs fichiers de séquence en presque égaux
pièces dimensionnées pour un traitement parallèle ultérieur. Même si vous avez 10 fichiers d'entrée sortant vers
10 fichiers équilibreront les fichiers pour contenir une longueur totale de séquence similaire. les identifiants sont
ignorés au moment de décider comment équilibrer chaque séquence.

Utilisez bp_seqpartp en ligne en utilisant les services onworks.net



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