cmtk-reformatx - En ligne dans le Cloud

PROGRAMME:

Nom

reformatx - Formateur de volume

SYNOPSIS

reformatx [options] --floating floatingImg cible x0 [x1 ...]
OU reformater [options] cible [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
OU O x0 ... xN et xx0 ... xxN est la transformation [{-i,--inverse}]##. (Si le premier
la transformation dans la séquence est inversée, alors '--inverse' doit être précédé de '--',
c'est-à-dire, utilisez '-- --inverse xform.path').

DESCRIPTION

Outil de reformatage de volume étendu pour calculer des images reformatées et des cartes jacobiennes à partir de
séquences arbitraires de transformations concaténées

OPTIONS

Global Boîte à outils Options (celles-ci commun by TOUTE CMTK outils)
--Aidez-moi
Écrire la liste des options de ligne de commande de base sur la sortie standard.

--aide-à tous
Écrivez la liste complète des options de ligne de commande de base et avancées sur la sortie standard.

- Wiki
Écrire la liste des options de ligne de commande sur la sortie standard dans le balisage MediaWiki.

--homme
Écrire la source de la page de manuel dans le balisage « nroff » sur la sortie standard.

--version
Écrire la version de la boîte à outils sur la sortie standard.

--écho
Écrire la ligne de commande actuelle sur la sortie standard.

--niveau détaillé
Définir le niveau de verbosité.

--verbeux, -v
Incrémentez le niveau de verbosité de 1 (obsolète ; pris en charge pour la compatibilité descendante).

--threads
Définir le nombre maximum de threads parallèles (pour les threads POSIX et OpenMP).

--le type de sortie
Type de données scalaire pour l'image de sortie. Valeurs prises en charge : "char", "byte", "short",
"ushort", "int", "uint", "float", "double", ou utilisez l'un des éléments suivants :

--carboniser
8 bits, signé

--octet
8 bits, non signé

--court
16 bits, signé

--ushort
16 bits, non signé

--int
32 bits signé

--uint
32 bits non signés

--flotter
32 bits virgule flottante

--double
64 bits virgule flottante

--pad-out , -P
Valeur de remplissage pour l'image de sortie [Défaut: 0]

Options en Plaine Reformatage
--interpolation
Méthode d'interpolation d'images. Valeurs prises en charge : "linear", "nn", "cubic", "pv", "sinc-
cosinus", "sinc-hamming", où la valeur par défaut est "linear", ou utilisez l'un des éléments suivants :

--linéaire
Interpolation trilinéaire [Ce is le défaut]

--nn Interpolation du plus proche voisin

--cubique
Interpolation tricubique

--pv Interpolation partielle de volume

--sinc-cosinus
Interpolation sinc avec fenêtre cosinus

--sinc-haming
Interpolation Sinc avec fenêtre de Hamming

--sinc-window-rayon
Rayon de la fenêtre pour l'interpolation Sinc [Défaut: 3]

--preserve-masse
Reformatage avec préservation de la masse : multipliez chaque valeur reformatée avec le Jacobien
déterminant de la transformation appliquée.

Options en Jacobien Carte Reformatage
--jacobian-correct-global
Corrigez les cartes jacobiennes à l'échelle mondiale.

--no-jacobian-correct-global
Ne corrigez pas les cartes jacobiennes à l'échelle mondiale. [Ce is le défaut]

Entrée Options
--grille-cible
Définir la grille cible pour le reformatage comme Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]
(dim:pixel:offset)

--masque, -m
Utilisez les données de pixels cibles comme masque binaire.

--recadrer
Rogner l'image cible : x0,y0,z0,x1,y1,z2

--target-décalage , -O
Remplacer le décalage de l'image cible et définir sur x,y,z mm

--target-offset-pixels
Remplacez le décalage de l'image cible et définissez-le sur dx, dy, dz pixels

--flottant , -F
Format et chemin de l'image flottante. [Défaut: RIEN]

--pad-flottant
Valeur de remplissage pour l'image flottante [Défaut: désactivée]

Sortie Options
--fichier de sortie , -o
Format et chemin de l'image de sortie. [Défaut: reformater.nii ]

Image/Transformation Base de données
--db
Chemin d'accès à la base de données d'images/de transformation qui doit être mise à jour avec le nouveau
l'image. [Défaut: RIEN]

AUTEURS

Torsten Rohlfing, avec les contributions de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff et Yaroslav Halchenko

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