Il s'agit de la commande fastq_to_fasta qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
fastq_to_fasta - Convertir les fichiers FASTQ en fichiers FASTA
DESCRIPTION
utilisation : fastq_to_fasta [-h] [-r] [-n] [-v] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Fait partie de FASTX
Boîte à outils 0.0.14 par A. Gordon (assafgordon@gmail.com)
[-h] = Cet écran d'aide utile.
[-r] = Renommer les identifiants de séquence en nombres.
[-n] = conserver les séquences avec des (N) nucléotides inconnus.
La valeur par défaut est de rejeter ces séquences.
[-v] = Verbose - rapporte le nombre de séquences.
Si [-o] est spécifié,
le rapport sera imprimé sur STDOUT.
Si [-o] n'est pas spécifié (et la sortie va vers STDOUT), le rapport sera imprimé sur
STDERR.
[-z] = Compresser la sortie avec GZIP.
[-i INFILE]
= fichier d'entrée FASTA/Q. la valeur par défaut est STDIN.
[-o OUTFILE] = fichier de sortie FASTA. la valeur par défaut est STDOUT.
Utilisez fastq_to_fasta en ligne en utilisant les services onworks.net