Il s'agit de la commande gt-seqstat qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
gt-seqstat - Calcule les statistiques pour le(s) fichier(s) fasta.
SYNOPSIS
gt séqstat fichier [options] [...]
DESCRIPTION
-v [oui|non]
être verbeux (par défaut : non)
-distiller [oui|non]
afficher la distribution de la longueur de la séquence (par défaut : non)
-b [Plus-value]
taille du bucket pour l'option distlen (par défaut : 100)
-binaire [oui|non]
utilisez un format binaire pour le nom de fichier de sortie de distlen : .distlen
bucketsize : 1 (par défaut : non)
-contigs [oui|non]
récapitulatif des statistiques des ensembles de contigs (par défaut : oui)
-un étirement [oui|non]
afficher la distribution des sous-chaînes A (par défaut : non)
-génome [Plus-value]
définir la longueur du génome pour le calcul NG50/NG80 (par défaut : 0)
-Aide
afficher l'aide pour les options de base et quitter
-aide+
afficher l'aide pour toutes les options et quitter
-version
afficher les informations de version et quitter
DE LA LIGNE BOGUES
Signaler des bogues àgt-users@genometools.org>.
Utilisez gt-seqstat en ligne en utilisant les services onworks.net