Il s'agit de la commande indigo-cano qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
indigo-cano - produit des SMILES canoniques ou du code en couches pour les molécules au format MOL ou SDF
SYNOPSIS
indigo-cano nom de fichier.{mol,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} [paramètres]
indigo-cano - Nos [paramètres]
DESCRIPTION
indigo-cano est utilisé pour produire des SMILES canoniques ou un code en couches pour les molécules en MOL ou
format SDF.
OPTIONS
indigo-cano attend un fichier ou un code SMILES sur l'entrée standard, qui peut alors être
suivi d'un ou plusieurs des paramètres suivants.
-les sourires
Sortir les SMILES canoniques (par défaut)
-en couches
Code en couches canonique de sortie
-identifiant
Champ ID avec le nom donné dans un fichier SDF
-pas d'arôme
Ne pas aromatiser les molécules
-non-tétraédrique
Ignorer les stéréocentres tétraédriques
-pas de cistrans
Ignorer les informations sur les obligations cis-trans
EXEMPLES
indigo-cano fichier.sdf
indigo-cano infile.sdf.gz -identifiant molregno > résultats.txt
indigo-cano fichier infile.smi -en couches -pas de cistrans
indigo-cano - 'NC1C=CC(O)=CC=1'
Utilisez indigo-cano en ligne en utilisant les services onworks.net